موضع در مقابل فلسفه و عرفان

وی از فلسفه و عرفان (حتی عرفان علمای مشهور شیعه) انتقادهای بسیار تندی دارد بگونه‌ای که در حاشیه درس خارجش، خطاب به طلبه‌ای که در مورد عرفان و فلسفه از وی پرسیده بود، گفت: «عرفان پیش من است، همهٔ مولوی را می‌خواهید پیش من است، هرجا را می‌خواهید برایت می‌گویم، فلسفه را بخواهید از اول اسفار تا آخر از هرجا بگی، از اول مفهوم وجود تا آخر مباحث طبیعیات برایت می‌گویم، اما همه‌اش کشک است. هرچه هست در قرآن و روایات است.»[۲۵]

حسن رمضانی از اساتید فلسفه و عرفان این برداشت و محالفت وی با فلسفه را نامناسب، جسورانه و خلاف انصاف و عدالت دانست.[۲۶]
محمدحسن وکیلی از استادان حوزه علمیه مشهد و از مدافعان فلسفه و عرفان اسلامی در نقد از مواضع وی اشاره کرده وحید خراسانی ۴ یا ۵ سال بیشتر فلسفه ندیده و از جوانی هم تحت تأثیر میرزا مهدی اصفهانی بوده و از نظر علمی فتوای فقیه در غیر از مسائل حوزه تخصّصی فقهی اعتبار ندارد.[۲۷]